由于全園區自海拔3,952米的玉山主峰直落至300米的拉庫拉庫溪底,氣溫隨著高度上升而遞減。除蘊涵有豐富的植物相外,另有豐富的動物及景觀等自然資源孕育其中。園區內豐饒珍貴的自然人文資源屬全民共享,這個環境最重要是給人們一個與大自然接觸的場所,做為心靈休憩、恢復生機的地方,也是留給后世子孫最美好純凈的樂土。
因面積廣大分為四大區:西北園區─位于玉山園區西北側,包括新中橫公路、塔塔加、東埔、觀高、八通觀、玉山主峰及楠溪林道等地區;南部園區─位于玉山園區西南部,包括南橫公路沿線、梅山─天池─中之關─埡口、南橫三山及關山等地區;東部園區─位于玉山園區東南側,包括南安、山風、瓦拉米、大分及新康山等地區;高山核心地區─位為玉山園區東北部及中央地帶,包括大水窟、秀姑巒山、馬博拉斯山、塔芬山、馬西山等地區。而于塔塔加游憩區、梅山游憩區、南安游憩區,分設三座游客中心,提供各項媒體欣賞、咨詢及解說等各項服務。
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